OncoProt

Vous voulez :

  • Construire un projet d’analyse protéomique exploratoire
  • Analyser le protéome d’une structure subcellulaire, de cellules ou fraction tissulaire
  • Identifier de nouveaux biomarqueurs pour le diagnostic, le pronostic ou pour prédire une réponse à un traitement
  • Quantifier un biomarqueur d’intérêt
  • Créer une banque de données protéomique
  • Réaliser une analyse de profilage protéomique sur tissus
  • Bénéficier d’un service de traitement bioinformatique, d’un support à la représentation graphique et à l’interprétation des données de protéomique

OncoProt

Les Services de OncoProt

Conception du design
analytique

Préparation des échantillons (coupe – microdissection)

Analyse protéomique par spectrométrie de masse

Traitement des
données brutes,
analyse statistique

Représentation graphique, analyse intégrative, support à l’interprétation

Tarifs : Devis sur demande

La plateforme Oncoprot propose d’associer la microdissection laser et la spectrométrie de masse pour étudier le protéome de tous types de structures cellulaires ou tissulaires

La microdissection permet d’isoler une population particulière de cellules ou une région cellulaire d’intérêt grâce à une découpe laser, à partir de prélèvements fixés au formol et inclus en paraffine.

Les protéines sont alors extraites après réversion de la fixation, et sont analysées en spectrométrie de masse pour les identifier et les quantifier. Par profilage protéomique, nous pouvons utiliser l’ensemble des protéines dérégulées comme une carte d’identité d’une pathologie ce qui permet de définir des profils de référence à valeur diagnostique, pronostique ou de réponse aux traitements.

Grâce à des outils de bioinformatique et de biologie intégrative dédiés et l’intervention du bioinformaticien de notre équipe, nous pouvons être support dans l’interprétation biologique des données de protéomique et dans la représentation graphique de vos résultats.

équipements

Contact

Directeur scientifique

Frédéric Saltel

Responsable technique

Anne Aurélie Raymond

Ingénieur R&D

Sylvaine Di Tommaso

Ingénieur Bioinformatique :

Cyril Dourthe

Localisation

Unité BaRITOn / INSERM U 1053
Bat 1A 3ème étage
Carreire Zone Nord
Université de Bordeaux
146, rue Léo Saignat
33076 BORDEAUX Cedex

Notre Équipe

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Anne Aurélie

Raymond

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Cyril

Dourthe

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