- Cytométrie en flux avec trieur
- Head Searcher : Julie Dechanet-Merville
Cytométrie en flux
Vous voulez :
- Analyser et phénotyper vos échantillons biologiques
- Trier vos suspensions cellulaires et particulaires
- Avoir des conseils pour mettre en place vos panels d’anticorps et vos marquages
Cytométrie Bordeaux
Les services de la plateforme Facsility
Mise à disposition des équipements après formation
Étude de faisabilité
Collaboration scientifique
Tarifs : Facturation à la minute du temps consommé
Spécificités : Trieur sous PSM, large choix d’analyseurs et de configurations optiques, cytométrie spectrale
Qualité : Réservation en ligne des instruments, serveur de stockage des données, 4 postes d’analyse Diva / Flowjo / Spectroflo, service accessible 24H/24
Qu’est-ce que la cytométrie?
Elle permet de mesurer sur une suspension de particules (cellules, bactéries, parasites, billes..) les caractéristiques individuelles de chaque particules telles que la taille, la forme et la complexité et n’importe quel composant ou fonction qui puisse être détecté par un composé fluorescent.
Sur le site de la société Thermo Fisher Scientific, vous trouverez deux excellentes présentations en anglais: introduction à la cytométrie et analyse des résultats.
Les spectres d’excitation et d’émission des principaux fluorochromes sont disponibles aux liens suivants: spectre fluorescence BD ou spectre fluorescence molecular probes.
Autres informations sur la cytométrie à partir du portail de l’International Society of Analytical Cytology
Formations
La plateforme propose deux formations pratiques de 2,5 jours en analyse multicouleur et tri cellulaire. Ces formations sont qualifiantes et labellisées CNRS entreprise.
Équipements
Analyseurs
- Un Accuri 4 couleurs
- Deux Canto II 8 couleurs avec passeur de plaques
- Un Fortessa 16 couleurs avec passeur de plaque
- Un Aurora Spectral, 67 paramètres, 5 lasers (UV, V, B, YG, R)
Trieurs
- Un Aria 16 couleurs sous PSM
- Un Melody 9 couleurs
- Un Aurora Spectral 40 paramètres, 4 lasers (V, B, YG, R), 6 voies
Analyseur BD ACCURI C6
Le BD Accuri C6 est équipé d’un laser bleu et rouge, deux détecteurs de morphologie et quatre détecteurs de fluorescence. Les données sont collectées numériquement sur des échelles de mesure très larges ne nécessitant pas de réglage des voltages des tubes photomultiplicateurs. Une pompe péristaltique unique, non pressurisée, mesure avec précision le volume de l’échantillon prélevé et peut calculer la concentration de l’échantillon par μL.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD ACCURI
Analyseur BD FACSCanto II
L’analyseur BD FACSCanto II est équipé de trois lasers à 488nm, 633nm et 407nm. Il permet l’analyse simultanée de 8 fluorescences. Il est équipé d’un passeur d’échantillon haut débit permettant l’automatisation du passage des échantillons en plaque.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSCanto II
Analyseur BD LSRFortessa
L’analyseur BD LSRFortessa est équipé de quatre lasers à 405nm, 488nm, 561nm et 640nm. Le laser 560nm permet une excitation optimale des fluorochromes rouge (phycoerythrine, DsRed, Tomato, Cherry…). Cet instrument permet l’analyse simultanée de 16 fluorescences et il est équipé d’un passeur de plaque à haut débit.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD LSRFortessa
Analyseur Cytek Aurora
L’analyseur spectral Aurora est équipé de 5 lasers: UV à 355nm, Violet à 405nm, Bleu à 488nm, Yellow /Green à 561nm et rouge à 640nm. Il possède 64 détecteurs de fluorescence et 3 de morphologie. La mesure des différences de signature spectrale sur tous les lasers et détecteurs permet la combinaison de fluorochromes incompatibles en cytométrie conventionnelle.
L’OMIP-069 a été publié en octobre 2020 avec l’analyse de 40 marqueurs d’un sang humain.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page Cytek Aurora
Trieur BD FACSMelody
Le BD FACSMelody™ est un trieur à buse unique de 100µm compatible avec tous les types cellulaires, permettant d’isoler jusqu’à 4 populations simultanément dans des tubes ou dans des plaques. La configuration optique 3 lasers et 9 paramètres de fluorescence (3V, 4B, 2R) permet d’identifier facilement la plupart de vos populations cellulaires à trier. La mise en route et le réglage automatique du tri, couplé au logiciel BD FACSChorus offrent la possibilité d’effectuer vos tris en totale autonomie.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSMelody
TRIEUR BD FACSARIA
Le trieur haut débit FACSAria permet de trier simultanément jusqu’à quatre populations cellulaires à une vitesse maximale de 10000 cellules à la seconde. Les lasers interfèrent avec les cellules lors de leur passage dans la cellule en quartz permettant une aussi bonne sensibilité de mesure des fluorescences que sur les analyseurs. L’analyse est réalisée en amont de la distribution des cellules dans les gouttes et n’est pas soumise aux instabilités possibles du jet comme sur les trieurs « jet in air ». L’Aria peut lire 16 fluorescences simultanément grâce aux sources d’excitation à 375nm, 407 nm, 488nm, 561nm et 633nm. Le module ACDU permet de recueillir les cellules triées dans des plaques 24, 96, sur des lames….
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page BD FACSAria
Trieur Cytek Aurora CS
Le trieur spectral Aurora CS est équipé de 4 lasers: Violet à 405nm, Bleu à 488nm, Yellow /Green à 561nm et rouge à 640nm. Il possède 40 détecteurs de fluorescence et 3 de morphologie. Comme l’analyseur Aurora, le CS offre les avantages de la technologie de l’analyse spectrale. Sa conception optique et son algorithme de déconvolution offrent une flexibilité accrue, permettant l’utilisation d’un large éventail de nouvelles combinaisons de fluorochromes. Avec un tri jusqu’à 6 voies, des choix de buse et des modes de tri personnalisables, une automatisation des réglages et une surveillance du flux de tri, le CS offre la flexibilité nécessaire pour répondre à toutes les applications.
Plus d’informations techniques sont disponibles sur la page Cytek AuroraCS
Logiciels disponibles
Flowjo
Logiciel de mise en page des résultats
FACSDiva Software
Ce logiciel est installé sur les CantoII, le Fortessa et l’Aria pour l’acquisition des données et leur mise en page.
BDFACSChorus Software
Logiciel de pilotage du trieur Melody
Cytek Spectroflo Software
Ce logiciel est installé sur l’Aurora Analyseur et de l’Aurora Trieur pour l’acquisition des données et leur en mise en page. Il est également disponible en accès libre sur les postes d’analyses.
Contact
- cytometrie@immuconcept.org
- 05.57.57.57.05
Planning et réservation :
Les cytomètres sont en accès libre selon leur disponibilité pour les utilisateurs formés et autonomes.
Pour les autres utilisateurs, une assistance technique est disponible sur rendez-vous.
Dans tous les cas, les appareils doivent être réservés
au moins 24 H à l’avance au lien suivant : Réservation
Les tris sont effectués uniquement par le personnel de la plateforme qui doit être prévenu au plus tard le vendredi de la semaine précédente. Les cellules mycoplasmées ou les échantillons présentant un danger biologique supérieur au niveau 2 (P2) sont refusés.
Stockage des données :
L’emploi de clé USB ou disque externe est strictement interdit. Utilisez le partage serveur quand vous êtes en cytométrie ou Pydio quand vous êtes à l’extérieur du service pour accéder à votre espace de sauvegarde sur le serveur du laboratoire.
Règlement intérieur :
Tout utilisateur du Service Commun de Cytométrie devra avoir lu le règlement intérieur et rempli le formulaire en ligne pour accéder au service.
Localisation
Université de BordeauxPlateforme FACSility
Laboratoire UMS 3427 / US 005
Bâtiment BBS
5e étage, S.5085
2 rue Hoffmann Martinot
33076 BORDEAUX Cedex
Tel : 05.57.57.57.05
