OneCell

Analyse de l'expression des gènes  
  • Quantifier, qualifier les acides nucléiques
  • Réaliser des PCR quantitatives en temps réel haut débit
  • Automatiser la préparation des plaques de PCR quantitatives
  • Préparer les librairies « Single cell » destinées au séquençage NGS

Les Services de OneCell

Conseil, formation et service à façon

Conseil pour l'extraction des
acides nucléiques

Quantification et qualification des acides nucléiques

PCR quantitatives en temps réel 96 et 384 puits

Préparation automatisée des plaques PCR

Analyse des résultats
ΔΔCq, Stantard Curve, Melte Curve

Préparation des librairies « Single cell » destinées
au séquençage

Accompagnement pour le séquençage NGS et les analyses bio-informatiques

À propos de Onecell

ONECELL met à disposition des équipements de pointe et guide les utilisateurs dans leurs études de l’expression de gènes. ONECELL permet l’extraction d’acides nucléiques (ADN et ARN) à partir de tissus (Tissue Lyser Qiagen), leur qualification et quantification (QuBit, Bioanalyser Tape Station Agilent), et leur amplification à grande échelle par PCR haut débit en temps réel (Robot EpMotion 5073 Eppendorf, CFX 96 et 384 puits BioRad, BioRad deepwell), de même que la génération de librairies pour des analyses multiomiques à l’échelle unicellulaire (Chromium Controller 10X Genomics). ONECELL guide les utilisateurs pour la mise en œuvre expérimentale, l’utilisation des appareils et l’analyse des résultats de PCR, et veille au contrôle qualité des acides nucléiques et des banques « Single Cell » générées en amont du séquençage. ONECELL met également à disposition un service à façon allant de la qualification des ARN et ADN jusqu’à la PCR et l’analyse des résultats.

équipements

  • Tissue Lyser Qiagen
  • mDrop Denovix
  • QuBit
  • Bioanalyser Tape Station 2200 Agilent 
  • Robot EpMotion 5073 Eppendorf
  • CFX 96 et 384 puits Bio-Rad
  • CFX 96 Deep Well Bio-Rad
  • Chromium Controller 10X Genomics

Chromium Controller 10X Genomics

Expression des gènes à l’échelle de la cellule unique

Workflow

Source : 10x Genomics

La Génération des GEM

La microfluidique est une technologie manipulant des fluides dans des microcanaux. Ainsi, nous pouvons isoler chaque cellule dans une micro-gouttelette d’huile contenant des réactifs (polymérase, oligonucléotide, retrotranscriptase…) et une bille particulière permettant un encodage spécifique de chaque transcrit appelée GEM (Gel bead in EMulsion).

10X barcode = 1 cellule
UMI = 1 ARN

Source : 10x Genomics

Source : Dolomite Microfluidics

Source : 10x Genomics

Visium Spatial 10X Genomics

Source : 10x Genomics

exemple de construction de librairies

Chromium Single Cell 3' Gene Expression Dual Index Library

Chromium Single Cell 3' Cell Surface Protein Dual Index Library

Contact

Responsable scientifique

Responsable technique

L’accès du bâtiment et de la plateforme de cytométrie est sécurisé par un digicode. Demander les codes au responsable lors de votre première visite.

Localisation

Plateforme de PCR quantitative en temps réel
Laboratoire UMS 3427 / US 005
Bat 1B 2ème étage
Carreire Zone Nord
Université de Bordeaux
146, rue Léo Saignat
33076 BORDEAUX Cedex

Notre Équipe