
- RT-PCR & Single Cell Libraries
- Responsable Technique : Xavier Gauthereau
OneCell
- Quantifier, qualifier les acides nucléiques
- Réaliser des PCR quantitatives en temps réel haut débit
- Automatiser la préparation des plaques de PCR quantitatives
- Préparer les librairies « Single cell » destinées au séquençage NGS
Les Services de OneCell
Conseil, formation et service à façon
Conseil pour l'extraction des
acides nucléiques
Quantification et qualification des acides nucléiques
PCR quantitatives en temps réel 96 et 384 puits
Préparation automatisée des plaques PCR
Analyse des résultats
ΔΔCq, Stantard Curve, Melte Curve
Préparation des librairies « Single cell » destinées
au séquençage
Accompagnement pour le séquençage NGS et les analyses bio-informatiques
À propos de Onecell
ONECELL met à disposition des équipements de pointe et guide les utilisateurs dans leurs études de l’expression de gènes. ONECELL permet l’extraction d’acides nucléiques (ADN et ARN) à partir de tissus (Tissue Lyser Qiagen), leur qualification et quantification (QuBit, Bioanalyser Tape Station Agilent), et leur amplification à grande échelle par PCR haut débit en temps réel (Robot EpMotion 5073 Eppendorf, CFX 96 et 384 puits BioRad, BioRad deepwell), de même que la génération de librairies pour des analyses multiomiques à l’échelle unicellulaire (Chromium Controller 10X Genomics). ONECELL guide les utilisateurs pour la mise en œuvre expérimentale, l’utilisation des appareils et l’analyse des résultats de PCR, et veille au contrôle qualité des acides nucléiques et des banques « Single Cell » générées en amont du séquençage. ONECELL met également à disposition un service à façon allant de la qualification des ARN et ADN jusqu’à la PCR et l’analyse des résultats.


équipements
- Tissue Lyser Qiagen
- mDrop Denovix
- QuBit
- Bioanalyser Tape Station 2200 Agilent
- Robot EpMotion 5073 Eppendorf
- CFX 96 et 384 puits Bio-Rad
- CFX 96 Deep Well Bio-Rad
- Chromium Controller 10X Genomics
Chromium Controller 10X Genomics
Expression des gènes à l’échelle de la cellule unique
Workflow
Source : 10x Genomics
La Génération des GEM
La microfluidique est une technologie manipulant des fluides dans des microcanaux. Ainsi, nous pouvons isoler chaque cellule dans une micro-gouttelette d’huile contenant des réactifs (polymérase, oligonucléotide, retrotranscriptase…) et une bille particulière permettant un encodage spécifique de chaque transcrit appelée GEM (Gel bead in EMulsion).
Source : 10x Genomics

Source : Dolomite Microfluidics

Source : 10x Genomics
Visium Spatial 10X Genomics

Source : 10x Genomics
exemple de construction de librairies
Chromium Single Cell 3' Gene Expression Dual Index Library
Chromium Single Cell 3' Cell Surface Protein Dual Index Library
Contact
L’accès du bâtiment et de la plateforme de cytométrie est sécurisé par un digicode. Demander les codes au responsable lors de votre première visite.
Localisation
Plateforme de PCR quantitative en temps réel
Laboratoire UMS 3427 / US 005
Bat 1B 2ème étage
Carreire Zone Nord
Université de Bordeaux
146, rue Léo Saignat
33076 BORDEAUX Cedex
Notre Équipe

Xavier
Gauthereau
